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Amino acid conservation.zip
Analysis of amino acid conservation using conservation index
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Chess Picture for visualizing correlation matrix.zip
A nice visualization for highlighting correlation matrix
alrededor de 12 años hace | 500 descargas |
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Ancestral polytree
The code here provides the algorithm of learning ancestral polytree.
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ProteinContactMap.zip
Visualization of protein contact map
alrededor de 12 años hace | 318 descargas |
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Maximum(minimum) Weight Spanning Tree ( Directed )
For learning "Directed Maximum Spanning Tree", Chu-Liu/Edmonds Algorithm is implemented here.
alrededor de 13 años hace | 4417 descargas |
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K2 algorithm for learning DAG structure in Bayesian network
This is the code of Cooper's K2 algorithm proposed in 1992, quick and convenient for using.
alrededor de 13 años hace | 3941 descargas |
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causal polytree algorithm 2004
A polytree algorithm published by M. Ouerd, B. John Oommen, Stan Matwin.
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Mistake in function "clustergram"
I found the clustergram in matlab 2012a made a mistake on parameter 'Standardize'. When one sets 'Standardize' to 3 (equally 'no...
más de 14 años hace | 0 respuestas | 0
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Fisher's exact test with n x m contingency table
Do you have problem with Fisher's exact test where the contingency table is more than 2*2?
casi 15 años hace | 3077 descargas |
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Discretization algorithms: Class-Attribute Contingency Coefficient
To discrete continuous data, CACC is a promising discretization scheme proposed in 2008
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CAIM Discretization Algorithm
CAIM (class-attribute interdependence maximization) is designed to discretize continuous data.
casi 16 años hace | 2189 descargas |
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Causal Polytree ---Pearl's classical algorithm(1988)
Pearl's famous causal polytree recover algorithm is implemented here.
más de 16 años hace | 827 descargas |
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Fisher's Exact Test for beginners.
For beginners, who loves Fisher's Exact Test but hates the theory behind.
más de 16 años hace | 945 descargas |
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Extended (n,k)-gray code
We extend normal gray code to conside about different range for each digit.
más de 16 años hace | 1437 descargas |
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Mutual Information In probability theory and information theory
Code for marginally and conditional mutual information in probability and information theory
más de 16 años hace | 2791 descargas |
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NPC algorithm for learning DAG in Bayesian network
NPC algorithm is designed for learning Bayesian network formed as DAG in 2001, by Steck
alrededor de 17 años hace | 1927 descargas |
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Maximum Weight Spanning tree (Undirected)
Chu-Liu-Edmonds Algorithm for learning "Undirected Maximum Weight Spanning tree" is proposed here.
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Probablistic Logic Sampling (PLS)
It is credited as 1th algorithm applying stochastic sampling to belief updating in Bayesian networks
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