SimBiology ofrece apps y herramientas programáticas para modelar, simular y analizar sistemas dinámicos, enfocadas en farmacología cuantitativa de sistemas (QSP), farmacocinética con base fisiológica (PBPK) y aplicaciones de farmacocinética y farmacodinamia (PK/PD). Puede crear modelos interactivamente con el editor de diagramas de bloques de SimBiology o de forma programática con el lenguaje de MATLAB. Los modelos se pueden crear desde cero, importar como archivos con formato SBML o a partir de ejemplos de modelos proporcionados en SimBiology.
SimBiology proporciona una serie de técnicas para analizar modelos basados en EDO que varían en complejidad y tamaño. Puede ejecutar simulaciones para determinar la viabilidad de objetivos, predecir la eficacia y seguridad de fármacos, e identificar regímenes de posología óptimos. Puede identificar protocolos y parámetros clave mediante análisis de sensibilidad local y global, así como evaluar la variabilidad biológica ejecutando barridos de parámetros. Para estimar parámetros, puede ajustar los datos empleando técnicas de regresión no lineal y efectos mixtos no lineales, así como realizar análisis no compartimental (NCA).
Cree modelos de QSP, PBPK y PK/PD
Cree modelos en SimBiology Model Builder como si los estuviera dibujando en una hoja de papel, o importe modelos SBML existentes. Utilice objetos de dosis y variantes para aplicar estrategias de posología (10:00) y guardar valores de cantidad alternativos.
Simule el comportamiento de modelos
Realice simulación con diversos solvers determinísticos y estocásticos empleando SimBiology Model Analyzer o herramientas programáticas. La conversión automática de unidades permite expresar todas las cantidades con un sistema de unidades uniforme. Genere informes a partir de análisis.
Ajuste datos para estimar parámetros
Estime parámetros utilizando regresión no lineal con métodos locales, globales o híbridos. Calcule intervalos de confianza de parámetros y predicciones. Tenga en cuenta efectos fijos y aleatorios en modelado de NLME.
Realice simulaciones Montecarlo
Realice barridos de parámetros y simulaciones Montecarlo para evaluar el comportamiento de un modelo en diferentes condiciones y regímenes de posología. Utilice controles deslizantes interactivos para observar cómo la variación de cantidades afecta a la respuesta del modelo.
Análisis de sensibilidad global y local
Explore los efectos de variaciones en las cantidades del modelo sobre la respuesta de modelos realizando análisis de sensibilidad. SimBiology permite realizar análisis globales, de Montecarlo y locales basados en la derivada.
Análisis no compartimental
Calcule parámetros PK a partir del curso temporal de concentraciones de un fármaco sin necesidad de asumir un modelo compartimental. Realice NCA en datos experimentales y de simulación para uno o múltiples esquemas de posología.
Acelere las simulaciones
Acelere simulaciones de modelos de gran tamaño o Montecarlo realizando conversión a código C compilado. Mejore aún más el rendimiento distribuyendo las simulaciones entre múltiples núcleos, clusters o recursos de la nube con Parallel Computing Toolbox.
Comparta modelos en forma de apps web
Cree apps en App Designer, empaquételas con MATLAB Compiler, y alójelas con MATLAB Web App Server. Otros colaboradores pueden acceder a las apps y ejecutarlas en un navegador, sin necesidad de instalar software.
Herramientas de la comunidad de usuarios
Utilice SimBiology de forma programática con scripts de MATLAB para personalizar y automatizar análisis. Las herramientas aportadas por la comunidad de usuarios se pueden utilizar como complementos para análisis de modelos, tales como simulaciones de poblaciones virtuales.
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