imregister

Registro de imágenes basado en la intensidad

Sintaxis

moving_reg = imregister(moving,fixed,transformType,optimizer,metric)

[moving_reg,R_reg] = imregister(moving,Rmoving,fixed,Rfixed,transformType,optimizer,metric)

___ = imregister(___,Name,Value)

Descripción

moving_reg = imregister(moving,fixed,transformType,optimizer,metric) transforma la imagen 2D o 3D, de modo que se registre con la imagen de referencia, .movingfixed Tanto las imágenes como las imágenes deben ser de la misma dimensionalidad, ya sea 2-D o 3-D. es un vector escalar o de caracteres de cadena que define el tipo de transformación que se va a realizar. es un objeto que describe el método para optimizar la métrica. es un objeto que define la medida cuantitativa de similitud entre las imágenes para optimizar.movingfixedtransformTypeoptimizermetric Devuelve la imagen alineada, .moving_reg

[moving_reg,R_reg] = imregister(moving,Rmoving,fixed,Rfixed,transformType,optimizer,metric) transforma la imagen a la que se hace referencia espacialmente para que se registre con la imagen a la que se hace referencia espacialmente. y son objetos de referencia espacial que describen los límites de coordenadas universales y la resolución de y .movingfixedRmovingRfixedmovingfixed

___ = imregister(___,Name,Value) especifica opciones adicionales con uno o más argumentos de par.Name,Value

Ejemplos

Registrar imágenes de RMN multimodales con Optimizer

Lee dos imágenes. Este ejemplo utiliza dos imágenes de resonancia magnética (RM) de una rodilla. La imagen fija es una imagen de eco de giro, mientras que la imagen en movimiento es una imagen de eco de giro con recuperación de inversión. Las dos rodajas sagitales fueron adquiridas al mismo tiempo, pero están ligeramente fuera de alineación.

fixed = dicomread('knee1.dcm'); moving = dicomread('knee2.dcm');

Vea las imágenes desalineadas.

imshowpair(fixed, moving,'Scaling','joint')

Cree el optimizador y la métrica, estableciendo la modalidad a ya que las imágenes provienen de diferentes sensores.'multimodal'

[optimizer, metric] = imregconfig('multimodal')

optimizer =    registration.optimizer.OnePlusOneEvolutionary    Properties:          GrowthFactor: 1.050000e+00               Epsilon: 1.500000e-06         InitialRadius: 6.250000e-03     MaximumIterations: 100 

metric =    registration.metric.MattesMutualInformation    Properties:     NumberOfSpatialSamples: 500      NumberOfHistogramBins: 50               UseAllPixels: 1 

Ajuste las propiedades del optimizador para que el problema converja en un máximo global y para permitir más iteraciones.

optimizer.InitialRadius = 0.009; optimizer.Epsilon = 1.5e-4; optimizer.GrowthFactor = 1.01; optimizer.MaximumIterations = 300;

Realice el registro.

movingRegistered = imregister(moving, fixed, 'affine', optimizer, metric);

Ver las imágenes registradas.

figure imshowpair(fixed, movingRegistered,'Scaling','joint')

Argumentos de entrada

moving — Imagen a registrar

imagen en escala de grises

Imagen que se va a registrar, especificada como una imagen en escala de grises 2D o 3D.

Tipos de datos: single | double | int8 | int16 | int32 | uint8 | uint16 | uint32

Rmoving — Información de referencia espacial asociada con la imagen que se va a registrar

u objetoimref2dimref3d

Información de referencia espacial asociada a la imagen que se va a registrar, especificada como u objeto.imref2dimref3d

fixed — Imagen de referencia en la orientación de destino

imagen en escala de grises

Imagen de referencia en la orientación de destino, especificada como una imagen en escala de grises.

Tipos de datos: single | double | int8 | int16 | int32 | uint8 | uint16 | uint32

Rfixed — Información de referencia espacial asociada con la imagen de referencia

u objetoimref2dimref3d

Información de referencia espacial asociada a la imagen de referencia (fija), especificada como u objeto.imref2dimref3d

transformType — Transformación geométrica que se aplicará a la imagen que se va a registrar

'translation' | 'rigid' | 'similarity' | 'affine'

Transformación geométrica que se aplicará a la imagen en movimiento, especificada como uno de los siguientes valores:

Valor	Descripción
'translation'	traducción en 2-D, o traducción en 3-D.(x,y)(x,y,z)
'rigid'	Transformación rígida consistente en traslación y rotación.
'similarity'	Transformación de similitud no reflectante que consiste en traducción, rotación y escala.
'affine'	Transformación afín que consiste en traslación, rotación, escala y cizallamiento.

Los tipos y los tipos de transformación siempre implican transformaciones no reflectantes.'similarity''affine'

Tipos de datos: char | string

optimizer — Método para optimizar la métrica de similitud

o objeto optimizadorRegularStepGradientDescentOnePlusOneEvolutionary

Método para optimizar la métrica de similitud, especificada como un objeto o optimizador.RegularStepGradientDescentOnePlusOneEvolutionary

metric — Métrica de similitud de imagen que se optimizará durante el registro

o objeto métricoMeanSquaresMattesMutualInformation

Métrica de similitud de imagen que se optimizará durante el registro, especificada como un objeto o objeto métrico.MeanSquaresMattesMutualInformation

Argumentos de par nombre-valor

Especifique pares opcionales separados por comas de argumentos. es el nombre del argumento y es el valor correspondiente. deben aparecer entre comillas.Name,ValueNameValueName Puede especificar varios argumentos de par de nombre y valor en cualquier orden como .Name1,Value1,...,NameN,ValueN

Ejemplo: permite el modo de optimización detallada.'DisplayOptimization',1

'DisplayOptimization' — Indicador de optimización detallado

false (predeterminado) | true

Indicador de optimización detallado, especificado como el par separado por comas que consta de , y el valor lógico o .'DisplayOptimization'truefalse Controla si muestra información de optimización en la ventana de comandos durante el proceso de registro.imregister

Tipos de datos: logical

'InitialTransformation' — Inicio de la transformación geométrica

u objetoaffine2daffine3d

Inicio de la transformación geométrica, especificada como el par separado por comas que consta de y un objeto u.'InitialTransformation'affine2daffine3d

'PyramidLevels' — Número de niveles piramidales utilizados durante el proceso de registro

3 (predeterminado) | entero positivo

Número de niveles de pirámide utilizados durante el proceso de registro, especificado como el par separado por comas que consta de y un entero positivo.'PyramidLevels'

Ejemplo: establece el número de niveles de pirámide en .'PyramidLevels',44

Tipos de datos: double

Argumentos de salida

moving_reg — Imagen transformada

matriz numérica

Imagen transformada, devuelta como matriz. Los píxeles de relleno introducidos que no se corresponden con las ubicaciones de la imagen original son .0

R_reg — Información de referencia espacial asociada con la imagen de salida

u objetoimref2dimref3d

Información de referencia espacial asociada a la imagen de salida, devuelta como u objeto.imref2dimref3d

Sugerencias

• Ambos y utilice el mismo algoritmo de registro subyacente. realiza el paso adicional de remuestreo para producir la imagen de salida registrada a partir de la estimación de transformación geométrica calculada por .imregtformimregisterimregistermovingimregtform Utilícelo cuando desee acceder a la transformación geométrica relacionada con .imregtformmovingfixed Utilícelo cuando desee una imagen de salida registrada.imregister

• Cree un y con la función antes de llamar a .optimizermetricimregconfigimregister Obtener buenos resultados del registro de imágenes basado en optimización normalmente requiere modificar la configuración del optimizador o de las métricas para el par de imágenes que se están registrando. La función proporciona una configuración predeterminada que solo debe considerarse un punto de partida.imregconfig Por ejemplo, si aumenta el número de iteraciones en el optimizador, reduce el tamaño del paso del optimizador o cambia el número de muestras en una métrica estocástica, el registro mejora a un punto, a expensas del rendimiento. Consulte la salida de para obtener más información sobre los diferentes parámetros que puede modificar.imregconfig

• Si el escalado espacial de las imágenes difiere en más de un 10%, cambie su tamaño antes de registrarlas.imresize

• Utilizar o visualizar los resultados del registro.imshowpairimfuse

• Puede utilizar en un flujo de trabajo automatizado para registrar varias imágenes.imregister

• Cuando tenga información de referencia espacial sobre la imagen que se va a registrar, especifique la información para utilizar objetos de referencia espacial.imregister Esto ayuda a converger para obtener mejores resultados más rápidamente porque se pueden tener en cuenta las diferencias de escala.imregister

Consulte también

Apps

• | Estimador de registro

Funciones

• imfuse | imregconfig | imregcorr | imregtform | imshowpair | imwarp

Temas

• Crear un optimizador y una métrica para el registro de imágenes basadas en intensidad
• Registro automático de imágenes basado en intensidad

Introducido en R2012a

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