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imregister

Registro de imágenes basado en la intensidad

Sintaxis

moving_reg = imregister(moving,fixed,transformType,optimizer,metric)

[moving_reg,R_reg] = imregister(moving,Rmoving,fixed,Rfixed,transformType,optimizer,metric)

___ = imregister(___,Name,Value)

Descripción

moving_reg = imregister(moving,fixed,transformType,optimizer,metric) transforma la imagen 2-D o 3-D, para que se registre con la imagen de referencia,.movingfixed Ambos e imágenes deben ser de la misma dimensionalidad, ya sea 2-D o 3-D. es una cadena escalar o un vector de caracteres que define el tipo de transformación que se va a realizar. es un objeto que describe el método para optimizar la métrica. es un objeto que define la medida cuantitativa de similitud entre las imágenes a optimizar.movingfixedtransformTypeoptimizermetric Devuelve la imagen alineada,.moving_reg

[moving_reg,R_reg] = imregister(moving,Rmoving,fixed,Rfixed,transformType,optimizer,metric) transforma la imagen de referencia espacialmente para que se registre con la imagen referenciada espacialmente. y son objetos de referencia espacial que describen los límites de coordenadas mundiales y la resolución y.movingfixedRmovingRfixedmovingfixed

___ = imregister(___,Name,Value) especifica opciones adicionales con uno o más argumentos de par.Name,Value

Ejemplos

Registre imágenes de RMN multimodal con Optimizer

Lee dos imágenes. Este ejemplo utiliza dos imágenes de resonancia magnética (RMN) de una rodilla. La imagen fija es una imagen de eco de giro, mientras que la imagen en movimiento es una imagen de eco de spin con recuperación de inversión. Las dos rebanadas sagital fueron adquiridas al mismo tiempo pero están ligeramente fuera de alineación.

fixed = dicomread('knee1.dcm'); moving = dicomread('knee2.dcm');

Ver las imágenes desalineadas.

imshowpair(fixed, moving,'Scaling','joint')

Crea el optimizador y la métrica, estableciendo la modalidad desde que las imágenes provienen de diferentes sensores.'multimodal'

[optimizer, metric] = imregconfig('multimodal')

optimizer =    registration.optimizer.OnePlusOneEvolutionary    Properties:          GrowthFactor: 1.050000e+00               Epsilon: 1.500000e-06         InitialRadius: 6.250000e-03     MaximumIterations: 100 

metric =    registration.metric.MattesMutualInformation    Properties:     NumberOfSpatialSamples: 500      NumberOfHistogramBins: 50               UseAllPixels: 1 

Ajuste las propiedades del optimizador para conseguir que el problema converja en un maxima global y permita más iteraciones.

optimizer.InitialRadius = 0.009; optimizer.Epsilon = 1.5e-4; optimizer.GrowthFactor = 1.01; optimizer.MaximumIterations = 300;

Realice el registro.

movingRegistered = imregister(moving, fixed, 'affine', optimizer, metric);

Visualiza las imágenes registradas.

figure imshowpair(fixed, movingRegistered,'Scaling','joint')

Argumentos de entrada

moving — Imagen que se registrará

imagen en escala de grises

Imagen que se registrará, especificada como una imagen en escala de grises en 2-D o 3-D.

Tipos de datos: single | double | int8 | int16 | int32 | uint8 | uint16 | uint32

Rmoving — Información de referencia espacial asociada a la imagen que se registrará

u objetoimref2dimref3d

Información de referencia espacial asociada a la imagen que se registrará, especificada como un objeto o.imref2dimref3d

fixed — Imagen de referencia en la orientación de destino

imagen en escala de grises

Imagen de referencia en la orientación de destino, especificada como una imagen en escala de grises.

Tipos de datos: single | double | int8 | int16 | int32 | uint8 | uint16 | uint32

Rfixed — La información de referencias espaciales asociada a la imagen de referencia

u objetoimref2dimref3d

Información de referencias espaciales asociada a la imagen de referencia (fija), especificada como un objeto o.imref2dimref3d

transformType — Transformación geométrica que se aplicará a la imagen que se registrará

'translation' | 'rigid' | 'similarity' | 'affine'

Transformación geométrica que se aplicará a la imagen en movimiento, especificada como uno de los siguientes valores:

Valor	Descripción
'translation'	traducción en 2-D, o traducción en 3-D.(x,y)(x,y,z)
'rigid'	Transformación rígida consistente en traducción y rotación.
'similarity'	Transformación de similitud no reflectante consistente en traducción, rotación y escala.
'affine'	Transformación afín consistente en traducción, rotación, escala y cizallamiento.

Los tipos de transformación y siempre implican transformaciones no reflectantes.'similarity''affine'

Tipos de datos: char | string

optimizer — Método para optimizar la métrica de similitud

o un objeto optimizadorRegularStepGradientDescentOnePlusOneEvolutionary

Método para optimizar la métrica de similitud, especificada como un objeto optimizador o.RegularStepGradientDescentOnePlusOneEvolutionary

metric — Métrica de similitud de imagen que se optimizará durante el registro

o un objeto métricoMeanSquaresMattesMutualInformation

Métrica de similitud de imagen que se optimizará durante el registro, especificada como un objeto o métrica.MeanSquaresMattesMutualInformation

Argumentos de par nombre-valor

Especifique pares de argumentos separados por comas opcionales. es el nombre del argumento y es el valor correspondiente. deben aparecer dentro de las cotizaciones.Name,ValueNameValueName Puede especificar varios argumentos de par de nombre y valor en cualquier orden como.Name1,Value1,...,NameN,ValueN

Ejemplo: habilita el modo de optimización detallado.'DisplayOptimization',1

'DisplayOptimization' — Indicador de optimización detallado

false (predeterminado) | true

Indicador de optimización detallado, especificado como el par separado por comas que consta de, y el valor lógico o.'DisplayOptimization'truefalse Controla si muestra la información de optimización en la ventana de comandos durante el proceso de registro.imregister

Tipos de datos: logical

'InitialTransformation' — Comenzando la transformación geométrica

u objetoaffine2daffine3d

Inicio de la transformación geométrica, especificada como el par separado por comas que consta de y un objeto.'InitialTransformation'affine2daffine3d

'PyramidLevels' — Número de niveles de pirámide utilizados durante el proceso de registro

3 (predeterminado) | entero positivo

Número de niveles de pirámide utilizados durante el proceso de registro, especificados como el par separado por comas y que consta de un entero positivo.'PyramidLevels'

Ejemplo: establece el número de niveles de pirámide.'PyramidLevels',44

Tipos de datos: double

Argumentos de salida

moving_reg — Imagen transformada

matriz numérica

Imagen transformada, devuelta como una matriz. Los píxeles de relleno introducidos que no correspondan a las ubicaciones de la imagen original son.0

R_reg — La información de referencia espacial asociada con la imagen de salida

u objetoimref2dimref3d

Información de referencia espacial asociada a la imagen de salida, devuelta como un objeto o.imref2dimref3d

Sugerencias

• Ambos y utilizan el mismo algoritmo de registro subyacente. realiza el paso adicional de remuestreo para generar la imagen de salida registrada a partir de la estimación de transformación geométrica calculada por.imregtformimregisterimregistermovingimregtform Utilíla cuando desee acceder a la transformación geométrica relacionada con.imregtformmovingfixed Utilíla cuando desee una imagen de salida registrada.imregister

• Cree una y con la función antes de llamar.optimizermetricimregconfigimregister Obtener buenos resultados del registro de imágenes basado en la optimización normalmente requiere modificar la configuración del optimizador o de las métricas para el par de fotos que se registran. La función proporciona una configuración predeterminada que solo debe considerarse un punto de partida.imregconfig Por ejemplo, si aumenta el número de iteraciones en el optimizador, reduce el tamaño del paso del optimizador o cambia el número de muestras en una métrica estocástica, el registro mejora a un punto, a expensas del rendimiento. Consulte la salida de para obtener más información sobre los diferentes parámetros que puede modificar.imregconfig

• Si el escalado espacial de las imágenes difiere en más de un 10%, redimensiónelos antes de registrarlos.imresize

• Utilice o para visualizar los resultados del registro.imshowpairimfuse

• Puede utilizar en un flujo de trabajo automatizado para registrar varias imágenes.imregister

• Cuando tenga información de referencia espacial sobre la imagen que se registrará, especifique la información para utilizar objetos de referencia espacial.imregister Esto ayuda a converger a mejores resultados más rápidamente porque se pueden tener en cuenta las diferencias de escala.imregister

Consulte también

Aplicaciones

• Registro estimador

Funciones

• imfuse | imregconfig | imregcorr | imregtform | imshowpair | imwarp

Temas

• Cree un optimizador y una métrica para el registro de imágenes basadas en intensidad
• Registro automático de imágenes basado en la intensidad

Introducido en R2012a

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